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Project group: DYNAmic MOdeling of stem cell organization   english  

Datum

    Begin: 3. März 2009, 13:00 Uhr
    Ende: 4. März 2009, ca. 16:45 Uhr
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Ort

    Universität Leipzig
    Institut für Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie (IMISE)
    Härtelstr. 16-18, 04107 Leipzig
    (1. Stock, "Rittersaal" - Eingang über Innenhof)

  • Google maps link für die Wegbeschreibung vom Leipziger Hauptbahnhof zum IMISE
    • 15-20 min Fußweg
    • Straßenbahn Nr. 10 (Richtung: "Lößnig") oder Nr. 11 (Richtung: "Markkleeberg-Ost") bis zur Haltestelle "Wilhelm-Leuschner-Platz"
      (2 Haltestellen bis zum Ziel; Kurzstreckenticket)
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    Zielstellung

      Basierend auf einer Vielzahl neuer technologischer Möglichkeiten hat sich die Menge und die Diversität zur Verfügung stehender quantitativer Daten, sowohl im experimentellen als auch im klinischen Kontext, in den letzten Jahren vervielfacht. Um zu einem umfassenden, systemischen Verständnis der jeweils betrachteten Prozesse zu gelangen, ist ein interdisziplinärer Forschungsansatz unumgänglich: Gezielte (Störungs-)Experi­mente und effiziente Messprotokolle sind ebenso notwendig wie eine fundierte statistische Aufarbeitung der Daten und eine Analyse des Systemverhaltens mittels dynamischer Modelle.

      Ziel des Workshops ist es, an verschiedenen Beispielen die interdisziplinäre Zusammenarbeit von Experimentatoren, Klinikern, Biostatistikern und Modellierern zu illustrieren. Der Workshop bietet die Möglichkeit eines intensiven, fachgebietsübergreifenden Erfahrungsaustausches sowie der Etablierung neuer Kooperationen. Im Gegensatz zu anderen systembiologischen Initiativen liegt der Schwerpunkt hierbei auf dem klar formulierten Bezug zu medizinisch motivierten Fragestellungen, d.h. zu einer Beschreibung von sowohl physiologischen als auch pathophysiologischen Vorgängen. In diesem Sinne werden einige Beispiele aus dem Verbundprojekt "HaematoSys", welches innerhalb des BMBF-Programmes zur "Medizinischen Systembiologie" ab März 2009 gefördert wird, berichtet.

      Zum Programm des Workshops gehört ebenfalls die Neuwahl des AG-Sprechers sowie die Planung weiterer AG-Aktivitäten und Veranstaltungen.
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    Themen (u.a.)

    • Krankheits- und Therapiemodelle
    • Dynamische Modelle von Prozessen der Gewebsorganisation
    • Analyse, Modellierung und Interpretation molekularer Regulationsprozesse
    • Modellierung von Surveillance- und Vorsorgestrategien
    • Systembiologische Analyse von Erkrankungen
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    Eingeladene Sprecher (u.a.)

    • Nick Baker (Uettrecht)
    • Dirk Drasdo (Paris)
    • Jan Hengstler (Düsseldorf)
    • Ralf Küppers (Essen)
    • Thilo Figge (Frankfurt)
    • Achim Tresch (München)
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    Programm (pdf)

    • Dienstag
        Session: Tissue organisation and disease models I

        13:00 - 13:30Nick Barker (Uetrecht)
        Lgr5 adult stem cells in self-renewal and cancer
        13:30 - 14:00Jörg Galle / Markus Löffler (Leipzig)
        Dynamic modeling of intestinal crypt dynamics
        14:00 - 14:25Holger Perfahl (Stuttgart)
        Modelling the distribution of therapeutics in tumours - A random walk approach
        14:25 - 14:50Bernd Schmeck (Berlin)
        Systems biology of lung inflammation
        14:50 - 15:25Haralambos Hatzikirou (Dresden)
        Unravelling the essential mechanisms of glioma growth

        - Coffee break -

        Session: Tissue organisation and disease models II

        15:50 - 16:40Dirk Drasdo (Paris) / Stefan Höhme (Leipzig)
        The systems biology of spatial-temporal liver regeneration after intoxication:
        experiment, image processing, mathematical modeling and back
        16:40 - 17:05Christian Bölling (Berlin)
        Network reconstruction, metabolic model and knowledge base of human hepatocytes
        17:05 - 17:30Eva Herrmann (Frankfurt)
        Advanced models for viral kinetics in patients chronically infected with Hepatitis C
        17:30 - 17:55Martin Hoffmann / Jörg Galle (Leipzig)
        Biological noise-regulation as a driving force for stem cell population dynamics
        17:55 - 18:20Sabine Hummert (Jena)
        Modeling Fungus-Phagocyte Interaction by Evolutionary Game Theory

    • Mittwoch
        Session: Bioinformatical and biostatistical methods

        09:00 - 09:30Achim Tresch (München)
        Stem cell differentiation analyzed by "MCMC without likelihoods"
        09:30 - 09:55Dieter Maier (Martinsried)
        Knowledge management in a Systems Biological approach to translational medicine
        09:55 - 10:20Michael Baudis (Zürich)
        Development and utilization of a reference database for CGH data

        - Coffee break -

        Session: Systems biology of the haematopoietic system I
        (Presentations by members of the HaematoSys-Network)

        10:45 - 11:15Ingo Röder (Leipzig)
        Model-based treatment optimisation for chronic myeliod leukemia
        11:15 - 11:45Marieke Esseres (Heidelberg)
        IFN-alpha activates dormant HSCs in vivo
        11:45 - 12:15Neuwahl des AG Vorsitzes

        - Lunch break -

        Session: Systems biology of the haematopoietic system II
        (Presentations by members of the HaematoSys-Network)

        13:15 - 13:45Ralf Küppers (Essen)
        The role of the germinal center reaction in B cell differentiation and lymphoma pathogenesis
        13:45 - 14:15Thilo Figge (Frankfurt)
        Modeling aspects of adaptive immunity in health and disease
        14:15 - 14:45Korbinian Strimmer (Leipzig)
        High-dimensional biomarker discovery under correlation

        - Coffee break -

        Session: Systems biology of the haematopoietic system III
        (Presentations by members of the HaematoSys-Network)

        15:15 - 16:00Manja Kamprad / Markus Scholz (Leipzig)
        Murine granulopoiesis after combined chemotherapy and G-CSF treatment - experiments and models
        16:00 - 16:45Ingmar Glauche (Leipzig) / Tilo Pompe (Dresden)
        Understanding stem cell fate decisions - Theory and experiment
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    Anmeldung/Abstracteinreichung

    • beendet
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    Konferenzsprache

    • Deutsch/Englisch
      (Aus Rücksicht gegenüber nicht-deutschsprachigen Teilnehmern, bitten wir um Präsentationen in englischer Sprache.)
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    Teilnahmegebühr

    • Unkostenbeitrag von 20 Euro (vor Ort zu entrichten)
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    Hotels

    • Wir empfehlen das Hotel Michaelis (ca. 10 Minuten Fußweg vom Veranstaltungsort).
    • Mögliche Alternativen sind zum Beispiel hier oder hier zu finden.
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    Organisation/Kontakt

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    Last Modified: 2009-01-27 webmaster@dynamo