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Datum |
Begin: 3. März 2009, 13:00 Uhr
Ende: 4. März 2009, ca. 16:45 Uhr |
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Ort |
Universität Leipzig
Institut für Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie (IMISE)
Härtelstr. 16-18, 04107 Leipzig
(1. Stock, "Rittersaal" - Eingang über Innenhof)
- Google maps link für die Wegbeschreibung vom Leipziger Hauptbahnhof zum IMISE
- 15-20 min Fußweg
- Straßenbahn Nr. 10 (Richtung: "Lößnig") oder Nr. 11 (Richtung: "Markkleeberg-Ost") bis zur Haltestelle "Wilhelm-Leuschner-Platz"
(2 Haltestellen bis zum Ziel; Kurzstreckenticket)
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Zielstellung |
Basierend auf einer Vielzahl neuer technologischer Möglichkeiten hat sich die Menge und die Diversität zur Verfügung stehender quantitativer Daten, sowohl im experimentellen als auch im klinischen Kontext, in den letzten Jahren vervielfacht. Um zu einem umfassenden, systemischen Verständnis der jeweils betrachteten Prozesse zu gelangen, ist ein interdisziplinärer Forschungsansatz unumgänglich: Gezielte (Störungs-)Experimente und effiziente Messprotokolle sind ebenso notwendig wie eine fundierte statistische Aufarbeitung der Daten und eine Analyse des Systemverhaltens mittels dynamischer Modelle.
Ziel des Workshops ist es, an verschiedenen Beispielen die interdisziplinäre Zusammenarbeit von Experimentatoren, Klinikern, Biostatistikern und Modellierern zu illustrieren. Der Workshop bietet die Möglichkeit eines intensiven, fachgebietsübergreifenden Erfahrungsaustausches sowie der Etablierung neuer Kooperationen. Im Gegensatz zu anderen systembiologischen Initiativen liegt der Schwerpunkt hierbei auf dem klar formulierten Bezug zu medizinisch motivierten Fragestellungen, d.h. zu einer Beschreibung von sowohl physiologischen als auch pathophysiologischen Vorgängen. In diesem Sinne werden einige Beispiele aus dem Verbundprojekt "HaematoSys", welches innerhalb des BMBF-Programmes zur "Medizinischen Systembiologie" ab März 2009 gefördert wird, berichtet.
Zum Programm des Workshops gehört ebenfalls die Neuwahl des AG-Sprechers sowie die Planung weiterer AG-Aktivitäten und Veranstaltungen.
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Themen (u.a.) |
- Krankheits- und Therapiemodelle
- Dynamische Modelle von Prozessen der Gewebsorganisation
- Analyse, Modellierung und Interpretation molekularer Regulationsprozesse
- Modellierung von Surveillance- und Vorsorgestrategien
- Systembiologische Analyse von Erkrankungen
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Eingeladene Sprecher (u.a.) |
- Nick Baker (Uettrecht)
- Dirk Drasdo (Paris)
- Jan Hengstler (Düsseldorf)
- Ralf Küppers (Essen)
- Thilo Figge (Frankfurt)
- Achim Tresch (München)
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Programm (pdf) |
- Dienstag
| Session: Tissue organisation and disease models I |
| 13:00 - 13:30 | Nick Barker (Uetrecht) |
| Lgr5 adult stem cells in self-renewal and cancer |
| 13:30 - 14:00 | Jörg Galle / Markus Löffler (Leipzig) |
| Dynamic modeling of intestinal crypt dynamics |
| 14:00 - 14:25 | Holger Perfahl (Stuttgart) |
| Modelling the distribution of therapeutics in tumours - A random walk approach |
| 14:25 - 14:50 | Bernd Schmeck (Berlin) |
| Systems biology of lung inflammation |
| 14:50 - 15:25 | Haralambos Hatzikirou (Dresden) |
| Unravelling the essential mechanisms of glioma growth |
- Coffee break -
| Session: Tissue organisation and disease models II |
| 15:50 - 16:40 | Dirk Drasdo (Paris) / Stefan Höhme (Leipzig) |
| The systems biology of spatial-temporal liver regeneration after intoxication: experiment, image processing, mathematical modeling and back |
| 16:40 - 17:05 | Christian Bölling (Berlin) |
| Network reconstruction, metabolic model and knowledge base of human hepatocytes |
| 17:05 - 17:30 | Eva Herrmann (Frankfurt) |
| Advanced models for viral kinetics in patients chronically infected with Hepatitis C | | 17:30 - 17:55 | Martin Hoffmann / Jörg Galle (Leipzig) |
| Biological noise-regulation as a driving force for stem cell population dynamics |
| 17:55 - 18:20 | Sabine Hummert (Jena) |
| Modeling Fungus-Phagocyte Interaction by Evolutionary Game Theory |
- Mittwoch
| Session: Bioinformatical and biostatistical methods |
| 09:00 - 09:30 | Achim Tresch (München) |
| Stem cell differentiation analyzed by "MCMC without likelihoods" |
| 09:30 - 09:55 | Dieter Maier (Martinsried) |
| Knowledge management in a Systems Biological approach to translational medicine |
| 09:55 - 10:20 | Michael Baudis (Zürich) |
| Development and utilization of a reference database for CGH data |
- Coffee break -
Session: Systems biology of the haematopoietic system I (Presentations by members of the HaematoSys-Network) |
| 10:45 - 11:15 | Ingo Röder (Leipzig) |
| Model-based treatment optimisation for chronic myeliod leukemia |
| 11:15 - 11:45 | Marieke Esseres (Heidelberg) |
| IFN-alpha activates dormant HSCs in vivo |
| 11:45 - 12:15 | Neuwahl des AG Vorsitzes |
- Lunch break -
Session: Systems biology of the haematopoietic system II (Presentations by members of the HaematoSys-Network) |
| 13:15 - 13:45 | Ralf Küppers (Essen) |
| The role of the germinal center reaction in B cell differentiation and lymphoma pathogenesis |
| 13:45 - 14:15 | Thilo Figge (Frankfurt) |
| Modeling aspects of adaptive immunity in health and disease |
| 14:15 - 14:45 | Korbinian Strimmer (Leipzig) |
| High-dimensional biomarker discovery under correlation |
- Coffee break -
Session: Systems biology of the haematopoietic system III (Presentations by members of the HaematoSys-Network)
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| 15:15 - 16:00 | Manja Kamprad / Markus Scholz (Leipzig)
| | Murine granulopoiesis after combined chemotherapy and G-CSF treatment - experiments and models |
| 16:00 - 16:45 | Ingmar Glauche (Leipzig) / Tilo Pompe (Dresden)
| | Understanding stem cell fate decisions - Theory and experiment |
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Anmeldung/Abstracteinreichung |
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Konferenzsprache |
- Deutsch/Englisch
(Aus Rücksicht gegenüber nicht-deutschsprachigen Teilnehmern, bitten wir um Präsentationen in englischer Sprache.)
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Teilnahmegebühr |
- Unkostenbeitrag von 20 Euro (vor Ort zu entrichten)
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Hotels |
- Wir empfehlen das Hotel Michaelis (ca. 10 Minuten Fußweg vom Veranstaltungsort).
- Mögliche Alternativen sind zum Beispiel hier oder hier zu finden.
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Organisation/Kontakt |
- Prof. Markus Löffler (Sekretariat Frau Will)
- Dr. Ingo Röder
- Robert Stein
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